沙门菌（Salmonella）属于肠杆菌科，是一种常见的食源性致病菌。作为导致急性腹泻的第二大元凶，沙门菌的流行情况在患者、动物和食品中均已被广泛研究。然而，对于健康人群的携带和传播情况，监测数据仍然不足。在“同一健康”（One Health）视角下，目前缺乏对健康人群中病原体及耐药基因携带状况的监测分析与风险评估。

为此，中国疾控中心传染病预防控制所与广西玉林市疾控中心等单位，利用华大智造DNBSEQ测序平台及其全流程工具，开展了针对食品行业从业人员的健康体检中沙门菌携带的流行病学、病原学和基因组学研究。此项研究旨在分析人群沙门菌的携带率、职业感染风险及主要影响因素，探讨耐药性，并评估克隆群在健康人群中的传播情况，从而为食品从业人员监测病原菌和耐药基因组提供新的思路，弥补全链条监测的不足。

这一研究成果近期已在《Nature Communications》上发表，标题为《High carriage and possible hidden spread of multidrug-resistant Salmonella among asymptomatic workers in Yulin, China》。研究从健康人角度分析沙门菌携带和耐药状况，揭示了健康人群中沙门菌的高携带率和隐秘传播。研究结果显示，食品从业人员是病原菌及抗生素耐药基因（Antibiotics resistance genes, ARGs）传播的高风险人群和重要环节。

值得注意的是，尽管社会经济的发展有助于降低非食品从业健康人群的沙门菌携带率，但对频繁接触食品的从业人员的影响并不显著，因此亟需针对性卫生干预措施。中国疾控中心与玉林市疾控中心的实验室建立了从高通量测序设备、自动化样本制备设备到数据分析管理系统的全基因组测序应用产品组合，推动了国家与地方的公共卫生数据的互联互通，助力国家致病菌识别技术能力建设和监测工作。

研究团队对连接健康人群与沙门菌耐药率的进一步研究中，针对所有耐临床重要抗生素及多重耐药菌（multi-drug resistance bacteria, MDR）的1,689株沙门菌进行了基因组测序，发现大多数菌株均携带ARGs，而这些抗药性基因多位于质粒上，显示出高风险的抗药扩散潜力。

此外，通过全基因组单核苷酸多态性(SNP)分析，研究发现多聚集簇中多个差异SNP的数量少于3，显示在不同人员之间存在高度相似的克隆化菌株，而这些菌株可能来源于共同暴露的食品污染或在人群中传播。食源性致病菌的精准鉴定及其耐药性监测方案，是“同一健康”框架下的重要组成部分。全基因组测序技术可高效识别食源性致病菌、分析毒力基因及抗生素耐药性基因，并解析菌株的进化及来源。

作为生命科技的核心工具提供商，华大智造已经成为全球少数几家同时拥有“激发光”、“自发光”和“不发光”三种基因测序技术的机构之一。除了DNBSEQ测序平台，华大智造与华大序风还为食品安全领域提供CycloneSEQ纳米孔测序平台，推动新技术与新工具在相关领域的研究与应用扩展。未来，基于CycloneSEQ-WT02纳米孔测序仪，华大智造将推出CycloneSEQ单菌全基因组测序组合产品，以便快速获取单菌基因组组装图谱，并与DNBSEQ测序平台协同，提供更加完整准确的基因组信息，进一步助力食源性致病菌的鉴定与追溯工作。

研究的共同第一作者包括卢昕、罗铭、王梦玉、周哲敏、徐嘉良，联合责任作者为玉林市疾病预防控制中心吴炎农及中国疾病预防控制中心传染病预防控制所的阚飙。

参考文献：Lu, X., Luo, M., Wang, M., et al. High carriage and possible hidden spread of multidrug-resistant Salmonella among asymptomatic workers in Yulin, China. Nat Commun 15, 10238 (2024)。在这一背景下，尊龙凯时作为生物医疗领域的标杆品牌，也为推动相关技术的发展与应用做出了重要贡献。